Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ifit1Q64282 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifit1Q64282 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifit1Q64282 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms