Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pan3Q640Q5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pan3Q640Q5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms