Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccdc18Q640L5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc18Q640L5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc18Q640L5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc18Q640L5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms