Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcf2lQ64096 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcf2lQ64096 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcf2lQ64096 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcf2lQ64096 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mcf2lQ64096 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcf2lQ64096 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcf2lQ64096 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcf2lQ64096 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcf2lQ64096 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcf2lQ64096 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcf2lQ64096 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcf2lQ64096 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcf2lQ64096 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms