Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col4a5Q63ZW6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a5Q63ZW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a5Q63ZW6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a5Q63ZW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms