Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vil1Q62468 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vil1Q62468 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vil1Q62468 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms