Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrhQ62361 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TrhQ62361 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TrhQ62361 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TrhQ62361 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrhQ62361 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrhQ62361 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TrhQ62361 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TrhQ62361 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms