Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim28Q62318 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim28Q62318 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim28Q62318 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms