Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf6Q62311 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Taf6Q62311 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Taf6Q62311 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms