Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpcQ62241 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpcQ62241 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms