Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Kdm5dQ62240 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Kdm5dQ62240 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Kdm5dQ62240 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Kdm5dQ62240 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms