Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six2Q62232 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six2Q62232 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six2Q62232 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six2Q62232 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six2Q62232 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms