Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SnrpaQ62189 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SnrpaQ62189 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms