Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssr4Q62186 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssr4Q62186 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssr4Q62186 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms