Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1a2Q62148 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1a2Q62148 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aldh1a2Q62148 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms