Protein–RNA interactions for Protein: Q61880

Dmc1, Meiotic recombination protein DMC1/LIM15 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmc1Q61880 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmc1Q61880 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dmc1Q61880 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmc1Q61880 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms