Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli3Q61602 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli3Q61602 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli3Q61602 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms