Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Foxg1Q60987 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxg1Q60987 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms