Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf3Q60980 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms