Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JrkQ60976 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JrkQ60976 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JrkQ60976 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JrkQ60976 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JrkQ60976 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms