Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncor1Q60974 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ncor1Q60974 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncor1Q60974 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms