Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rbbp7Q60973 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rbbp7Q60973 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms