Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis1Q60954 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms