Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tbc1d1Q60949 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tbc1d1Q60949 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbc1d1Q60949 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms