Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atf3Q60765 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atf3Q60765 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atf3Q60765 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atf3Q60765 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms