Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcf4Q60722 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf4Q60722 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms