Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik1Q60670 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik1Q60670 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik1Q60670 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik1Q60670 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik1Q60670 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik1Q60670 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik1Q60670 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms