Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sin3aQ60520 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sin3aQ60520 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sin3aQ60520 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms