Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf123Q5XPI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf123Q5XPI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf123Q5XPI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms