Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q5XFZ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q5XFZ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms