Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uimc1Q5U5Q9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uimc1Q5U5Q9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uimc1Q5U5Q9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms