Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdcp1Q5U462 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdcp1Q5U462 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdcp1Q5U462 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdcp1Q5U462 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdcp1Q5U462 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdcp1Q5U462 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdcp1Q5U462 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdcp1Q5U462 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms