Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms