Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Utp18Q5SSI6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp18Q5SSI6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Utp18Q5SSI6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms