Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps54Q5SPW0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps54Q5SPW0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps54Q5SPW0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms