Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna2d4Q5RJF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms