Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r209Q5NC97 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vmn1r209Q5NC97 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms