Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kctd1Q5M956 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kctd1Q5M956 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kctd1Q5M956 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms