Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps41Q5KU39 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps41Q5KU39 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms