Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ecm2Q5FW85 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm2Q5FW85 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ecm2Q5FW85 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm2Q5FW85 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm2Q5FW85 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
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