Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp22Q5DU02 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp22Q5DU02 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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