Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam208bQ5DTT3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam208bQ5DTT3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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