Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox3aQ4TU90 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox3aQ4TU90 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3aQ4TU90 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms