Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Brinp3Q499E0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Brinp3Q499E0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brinp3Q499E0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brinp3Q499E0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms