Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg1lQ3V384 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg1lQ3V384 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms