Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Esf1Q3V1V3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Esf1Q3V1V3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Esf1Q3V1V3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Esf1Q3V1V3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms