Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2Q3V1H1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap2Q3V1H1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ckap2Q3V1H1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms