Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ulk4Q3V129 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ulk4Q3V129 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms