Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc110Q3V125 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc110Q3V125 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc110Q3V125 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms