Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700057G04RikQ3V0U0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700057G04RikQ3V0U0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700057G04RikQ3V0U0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms